薬用植物総合情報データベース

遺伝子情報

生薬名シャクヤク
モデル試料NIB-0098
遺伝子領域ITS
Accession No.
Locus
Length
Definition
Version
Keywords
Source organism
Taxon
Voucher No.
Habitat
Collection date
SequenceTCGAACCTGC CTAGCAGAAC GACCAGCGAA CTTGTAAAAA TGCTCGGGAT GACGGAAGGC
GTGAGCCTTT CCTTCATCCC ATGTCCGGTC GCGCCAGACG TTGAGTCTCC CCTCGCACGA
TGTGCAGGGA AGCGCCAAGG TTCTGGTGTG CTCTCGGATT TACAACAACC CCCGGCGCAA
ACCGCGCCAA GGAACTAAAA CGAAAGAGCA TGCCCCYGTT GCCCCAGCTT TGGGATGCRC
GGGAGKTAAT GTCTTCTTTT ACATATCAAA ACGACTCTCG GCAACGGATA TCTCGGCTCT
CGCATCGATG AAGAACGTAG CGAAATGCGA TACTTGGTGT GAATTGCAGA ATCCCGTGAA
TCACCGAGTC TTTGAACGCA AGTTGCGCCC AAAGCCTTTA GGCTGAGGGC ACGTCTGCCT
GGGCGTCACG TATCCCGTCG CACCCCYAAC CCGTCCAAAC TCGGGCATGA TGGCTGGTGG
GAGCGGATAT TGGCCTCCCG TGTACTCGCG TTACGGTTGG TTTAAAATCG AGCCCCGAGC
GACGAACGTC ACGACAAGTG GTGGTCTGTA ATAGCTATTT CGTGTTGTGC GTTGTCTCGT
CGCCCGTGGG AGCTCAYAAA KACCCCAAAG CATCGTCACG ATGATGCATC CA
Reference
データ提出者Katsuko Komatsu
備考データベース上のPaeonia lactifloraの配列と99%以上の相同性を示す。P. lactifloraにおいては、ITS配列の種内多型が認められたことを鑑み、P. lactifloraであると判断した。また、上流から69番目、458番目及び523番目の塩基に着目すると、白芍系に属することと判断した。 プライマー配列 (5'-3') forward TCC ACT GAA CCT TAT CAT TTA G TCT CGC ATC GAT GAA GAA CG reverse CCA TGC TTA AAC TCA GCG GGT CCA TGC TTA AAC TCA GCG GGT
遺伝子鑑別関連情報
遺伝子鑑別情報 Sequencing(direct)