遺伝子情報
生薬名 | シャクヤク |
モデル試料 | NIB-0129 |
遺伝子領域 | ITS |
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Sequence | TCGAACCTGC CTAGCAGAAC GACCAGCGAA CTTGTAAAAA TGCTCRGGAT GACGGAAGGC GTGAGCCTYT CCTTCATCCC ATGTCCGGTC GCRCCAGACG TTGAGTCTCC CCTCGCACGA TGTGYAGGGA AGCGCCAAGG TTCTGGTGTG CTCTCGGATT TACAACAACC CCCGGCGCAA ACCGCGCCAA GGAACTAAAA CGAAAGAGCA TGCCCCCGTT GCCCCAGCTT TGGGATGCGC GGGAGGTAAT GTCTTCTTTT ACATATCAAA ACGACTCTCG GCAACGGATA TCTCGGCTCT CGCATCGATG AAGAACGTAG CGAAATGCGA TACTTGGTGT GAATTGCAGA ATCCCGTGAA TCACCGAGTC TTTGAACGCA AGTTGCGCCC AAAGCCTTTA GGCTGAGGGC ACGTCTGCCT GGGCGTCACG TATCCCGTCG CACCCCCAAC CCGTCCMAAC TCGGGCATGA TGGCTGGTGG GAGCGGATAT TGGCCTCCCG TGTACTCGCG TTACGGTTGG TYTAAAATCG AGCCCCGAGC GACGAACGTC ACGACAAGTG GTGGTCTGTA ATAGCTATTT CGTGTTGTGC GTTGTCTCGT CGCCCGTGGG AGCTCACAAA KACCCCAAAG CATCGTCACG ATGATGCATC CA |
Reference | |
データ提出者 | Katsuko Komatsu |
備考 | データベース上のPaeonia lactifloraの配列と99%以上の相同性を示す。P. lactifloraにおいては、ITS配列の種内多型が認められたことを鑑み、P. lactifloraであると判断した。また、上流から69番目、458番目及び523番目の塩基に着目すると、赤芍系に属することと判断した。 プライマー配列 (5'-3') forward TCC ACT GAA CCT TAT CAT TTA G TCT CGC ATC GAT GAA GAA CG reverse CCA TGC TTA AAC TCA GCG GGT CCA TGC TTA AAC TCA GCG GGT |
遺伝子鑑別関連情報 | |
遺伝子鑑別情報 | Sequencing(direct) |