薬用植物総合情報データベース

遺伝子情報

生薬名オウレン
モデル試料NIB-0041
遺伝子領域ITS1, rpl16-rpl14
Accession No.
Locus
Length
Definition
Version
Keywords
Source organism
Taxon
Voucher No.NIB-0041 41-1
Habitat
Collection date
Sequence
Reference
データ提出者Noriaki KAWANO (NIBIOHN)
備考生薬オウレンの市場流通モデル試料10検体について、核rDNA ITS1領域および、葉緑体DNA rpl16-rpl14領域の塩基配列情報を収集・解析した。その結果、市場流通オウレン由来のITS1領域は、1検体に1~数種の配列タイプが存在することが判明し、これらは国際遺伝子データベース登録配列と同一であるものと、新規配列である場合があった。また、葉緑体DNA rpl16-rpl14領域は、まず国内産系統と中国産系統に分類され、さらに中国系統はCoptis teetaを基原とするものと、その他に分類されることが判明した。なお、局方非収載のC. omeiensis型の配列を有する検体は認められなかった。
遺伝子鑑別関連情報 NIB_Coptis_Genetic_variation.pdf(Sequence alignment)
遺伝子鑑別情報 Sequencing(cloned)