薬用植物総合情報データベース

遺伝子鑑別情報

鑑別法Sequencing(direct)
鑑別レベル種 (species)
鑑別結果(解説)市場に流通するサンシシの核rDNA ITS2領域及び葉緑体DNA trnL-F IGS領域の塩基配列を解析した結果、全ての試料がデータベース上に登録されているGardenia jasminoidesの配列と一致するかあるいは良く似た配列を示した。ただし、この結果のみをもって基原種を特定するには、G. jasminoidesの種内変異の範囲について情報収集する必要がある。 比較に用いた Gardenia jasminoides, G. hansemannii, G. thunbergia の各アクセッション番号は,GQ434646, FM204691, AJ224833である。
備考種あるいは種内系統の鑑別に用いられる プライマー配列 (5'-3') 1st round forward GCA TCG ATG AAG AAC GTA GCG reverse TTT TCC TCC GCT TAT TGA TAT GC プライマー配列 (5'-3') 2nd round forward GCA TCG ATG AAG AAC GTA GCG (1st round と同一) reverse GTA GTC CCG CCT GAC CTG
関連する生薬名サンシシ
遺伝子情報 サンシシ(ITS2,GQ434646,GARDENIAE FRUCTUS) , サンシシ(ITS2,FM204691,GARDENIAE FRUCTUS)
サンシシ(ITS2,AJ224833,GARDENIAE FRUCTUS) , サンシシ(ITS2,NIB-0019)
サンシシ(ITS2,NIB-0097) , サンシシ(ITS2,NIB-0125)
サンシシ(ITS2,NIB-0192) , サンシシ(ITS2,NIB-0020)
サンシシ(ITS2,NIB-0044) , サンシシ(ITS2,NIB-0081)
サンシシ(ITS2,NIB-0124) , サンシシ(ITS2,NIB-0193)
サンシシ(ITS2,NIB-0154) , サンシシ(ITS2,NIB-0224)
遺伝子鑑別結果情報 
ファイル名ITS2 alignment-db.tif
PubMedID
書誌情報
備考