ファイル名 | ITS2 alignment-db.tif |
PubMedID | |
書誌情報 | |
備考 |
遺伝子鑑別情報
鑑別法 | Sequencing(direct) |
鑑別レベル | 種 (species) |
鑑別結果(解説) | 市場に流通するサンシシの核rDNA ITS2領域及び葉緑体DNA trnL-F IGS領域の塩基配列を解析した結果、全ての試料がデータベース上に登録されているGardenia jasminoidesの配列と一致するかあるいは良く似た配列を示した。ただし、この結果のみをもって基原種を特定するには、G. jasminoidesの種内変異の範囲について情報収集する必要がある。 比較に用いた Gardenia jasminoides, G. hansemannii, G. thunbergia の各アクセッション番号は,GQ434646, FM204691, AJ224833である。 |
備考 | 種あるいは種内系統の鑑別に用いられる プライマー配列 (5'-3') 1st round forward GCA TCG ATG AAG AAC GTA GCG reverse TTT TCC TCC GCT TAT TGA TAT GC プライマー配列 (5'-3') 2nd round forward GCA TCG ATG AAG AAC GTA GCG (1st round と同一) reverse GTA GTC CCG CCT GAC CTG |
関連する生薬名 | サンシシ |
遺伝子情報 |
サンシシ(ITS2,GQ434646,GARDENIAE FRUCTUS)
,
サンシシ(ITS2,FM204691,GARDENIAE FRUCTUS)
サンシシ(ITS2,AJ224833,GARDENIAE FRUCTUS) , サンシシ(ITS2,NIB-0019) サンシシ(ITS2,NIB-0097) , サンシシ(ITS2,NIB-0125) サンシシ(ITS2,NIB-0192) , サンシシ(ITS2,NIB-0020) サンシシ(ITS2,NIB-0044) , サンシシ(ITS2,NIB-0081) サンシシ(ITS2,NIB-0124) , サンシシ(ITS2,NIB-0193) サンシシ(ITS2,NIB-0154) , サンシシ(ITS2,NIB-0224) |
遺伝子鑑別結果情報 | |
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