薬用植物総合情報データベース

遺伝子鑑別情報

鑑別法Sequencing(direct)
鑑別レベル種 (species)
鑑別結果(解説)市場に流通するサンシシの核rDNA ITS2領域及び葉緑体DNA trnL-F IGS領域の塩基配列を解析した結果、全ての試料がデータベース上に登録されているGardenia jasminoidesの配列と一致するかあるいは良く似た配列を示した。ただし、この結果のみをもって基原種を特定するには、G. jasminoidesの種内変異の範囲について情報収集する必要がある。 比較に用いた Gardenia jasminoides, G. hansemannii, G. thunbergia, G. taitensis, G. volkensii subsp. spanthulifolia の各アクセッション番号は,FJ493345, FM207126, DQ180583, AF102426, AF201044である。
備考種あるいは種内系統の鑑別に用いられる プライマー配列 (5'-3') 1st round forward CCG TCG ACT TTA AAA ATC GTG reverse ATT TGA ACT GGT GAC ACG AG プライマー配列 (5'-3') 2nd round forward GGT TCA AGT CCC TCT ATC CCC A reverse ATT TGA ACT GGT GAC ACG AG (1st round と同一)
関連する生薬名サンシシ
遺伝子情報 サンシシ(trnL-F,FJ493345,GARDENIAE FRUCTUS) , サンシシ(trnL-F,FM207126,GARDENIAE FRUCTUS)
サンシシ(trnL-F,DQ180583,GARDENIAE FRUCTUS) , サンシシ(trnL-F,AF102426,GARDENIAE FRUCTUS)
サンシシ(trnL-F,AF201044,GARDENIAE FRUCTUS) , サンシシ(trnL-F,NIB-0019)
サンシシ(trnL-F,NIB-0081) , サンシシ(trnL-F,NIB-0224)
サンシシ(trnL-F,NIB-0020) , サンシシ(trnL-F,NIB-0097)
サンシシ(trnL-F,NIB-0154) , サンシシ(trnL-F,NIB-0192)
サンシシ(trnL-F,NIB-0193) , サンシシ(trnL-F,NIB-0125)
サンシシ(trnL-F,NIB-0044) , サンシシ(trnL-F,NIB-0124)
遺伝子鑑別結果情報 
ファイル名Alignment-db-1.tif
PubMedID
書誌情報
備考

ファイル名Alignment-db-2.tif
PubMedID
書誌情報
備考